药物流产的最佳时间通常是在怀孕49天以内，此时孕囊较小且药物作用效果较好。但具体时间还需结合孕囊大小及孕妇身体情况综合评估，建议在医生指导下进行。
药物流产主要适用于孕49天内且孕囊直径小于2-3厘米的情况。此时子宫蜕膜组织较薄，米非司酮和米索前列醇能有效阻断孕酮活性并促进子宫收缩，完全流产率可达90%以上。若超过49天，胎盘组织逐渐形成，药物难以完全排出胚胎组织，可能导致不全流产或大出血。
进行药物流产前需通过B超确认宫内妊娠及孕周，排除宫外孕及葡萄胎等异常情况。血常规、凝血功能等检查可评估出血风险，有严重贫血或凝血障碍者不宜采用。用药后需严格遵医嘱观察出血量和孕囊排出情况，若出血超过月经量或持续腹痛需立即就诊。
药物流产必须在正规医疗机构进行，用药后需留院观察4-6小时。流产后2周应复查B超确认宫腔情况，1个月内禁止盆浴和性生活。出现发热、持续阴道流血或分泌物异味等感染症状时，应及时就医进行抗感染治疗。