舒肝健胃丸和舒肝和胃丸在药物成分、功效侧重以及适应症等方面存在一定差异，需根据具体病情遵医嘱选择。
1、药物成分不同
舒肝健胃丸主要由柴胡、香附、陈皮等疏肝理气药材组成，辅以焦三仙、鸡内金等健胃消食成分；舒肝和胃丸则含有香附、白芍、佛手等疏肝解郁药材，同时配伍白术、茯苓等健脾和胃成分。两者虽均有疏肝作用，但配伍重点不同。
2、功效侧重不同
舒肝健胃丸侧重于疏肝理气的同时增强胃动力，改善食积不化、脘腹胀满等症状；舒肝和胃丸则更注重调和肝胃气机，缓解肝郁气滞引起的胸胁胀痛、恶心嗳气等症，对脾胃虚弱伴随肝郁的情况更具针对性。
3、适应症不同
舒肝健胃丸适用于肝郁气滞兼有饮食积滞的病症，如饭后腹胀、反酸烧心；舒肝和胃丸多用于肝胃不和引起的功能性消化不良，如情绪波动后胃痛、食欲不振伴胸闷等。
使用这两种中成药前应经中医师辨证，明确肝郁类型及脾胃状态。避免自行用药掩盖器质性疾病，服药期间需忌食辛辣油腻，保持情绪舒畅。若服用两周症状未缓解，应及时就诊调整治疗方案。