羌活和独活均具有祛风除湿、散寒止痛的功效，但羌活长于治疗上半身痹痛，独活多用于下半身痹痛，且解表力较弱。两者在性味归经、作用部位及临床应用上存在差异。
1、共同功效
两者均属祛风湿药，性味辛温，能祛除肌表风寒湿邪，缓解风湿痹痛。对于风寒湿邪侵袭引起的关节疼痛、屈伸不利，两者均可发挥治疗作用。此外，二者也常用于风寒感冒，尤其对伴有头身疼痛者有一定效果。
2、羌活的功效特点
羌活辛散燥烈，主入膀胱经，善祛上部风湿。其解表散寒力强，尤适用于肩背肢节等上半身疼痛，对太阳经头痛（后脑牵连项部）效果显著。临床常用于治疗肩周炎、颈椎病等属风寒湿证者。
3、独活的功效特点
独活味兼苦，性微温，主入肾经，偏治腰膝、腿足等下半身痹痛。其性较羌活缓和，解表力弱但祛湿力强，更长于治疗久痹顽症。对于寒湿导致的腰椎间盘突出、坐骨神经痛等病症更为适用。
4、作用部位差异
羌活药性上行，多用于项背、上肢等身体上部疼痛；独活药性下行，侧重治疗髋部、下肢等身体下部疼痛。二者常配伍使用以增强祛风除湿效果，如羌活胜湿汤中即合用两药。
5、合用增效
临床治疗周身痹痛或风湿日久者，常将羌活与独活配伍应用。羌活发散力强可驱除新感之邪，独活祛湿力专可清体内伏邪，两者协同能增强通络止痛效果，适用于类风湿关节炎等慢性病症。
两者均需辨证使用，湿热痹痛者慎用。具体用药需根据疼痛部位、病程长短及体质特点进行选择，建议在中医师指导下配伍使用。治疗期间应注意关节保暖，避免久居潮湿环境。