纳氏囊肿有可能自愈，但需根据囊肿大小、症状等因素综合判断。多数情况下体积较小且无伴随症状的囊肿存在自愈可能，而体积较大或合并感染的囊肿通常无法自行消退。
体积较小的纳氏囊肿多为宫颈腺体分泌物潴留形成的生理性改变，在腺管恢复通畅后，囊液可能被吸收或排出，囊肿随之消失。这类囊肿通常不会引起阴道异常出血、分泌物增多等症状，患者仅需遵医嘱定期复查，监测囊肿变化即可。若囊肿因炎症刺激导致腺管开口肿胀阻塞，在炎症消退后也可能自愈，但需配合医生排查是否有病原体感染。
对于直径超过1厘米、反复合并感染或引起同房后出血等症状的囊肿，自愈概率较低。这类囊肿可能压迫周围组织形成持续性肿胀，或合并细菌、支原体等病原体感染，导致宫颈充血、脓性分泌物增多。此时需通过激光、微波等物理治疗消除囊肿，若存在衣原体感染可遵医嘱使用阿奇霉素片、盐酸多西环素片等药物控制感染。
建议确诊纳氏囊肿的女性每6-12个月进行妇科检查，日常注意保持外阴清洁干燥。若出现阴道排液异常、接触性出血或下腹坠胀感，应及时到妇科就诊评估囊肿状态，避免自行使用阴道冲洗液等产品干扰宫颈自洁功能。