蒙头睡觉容易引发缺氧、二氧化碳浓度升高、睡眠质量下降以及细菌感染等健康隐患，长期如此可能对身体造成不良影响。这种情况会干扰正常的呼吸和生理功能，建议及时调整睡姿习惯。
蒙头睡觉时，被子内的空气流通受阻，氧气供应不足，可能导致大脑缺氧。缺氧会引起晨起后头晕、头痛、注意力不集中等症状，长期如此还可能影响记忆力和认知功能。被窝内二氧化碳浓度升高会刺激呼吸中枢，导致呼吸频率加快，但实际换气效率反而降低。
睡眠过程中人体持续释放湿气和热量，蒙头睡觉会使被内湿度过高。这种潮湿环境容易引发皮肤湿疹、痤疮等皮肤问题，对患有呼吸道疾病的人群还可能诱发咳嗽、胸闷等不适。高温高湿环境还会促进尘螨、细菌繁殖，增加眼部感染和呼吸道感染风险。
长期蒙头睡觉可能形成恶性循环，睡眠质量下降会引发日间嗜睡、情绪烦躁等问题。建议选择透气性良好的寝具，保持卧室空气流通，睡前避免饮用含咖啡因饮料。若已出现持续性头痛、记忆力减退等症状，应及时到呼吸内科或神经内科就诊检查。