克罗恩病在诊断时通常需要与溃疡性结肠炎、肠结核以及肠淋巴瘤等疾病进行鉴别，具体需结合临床表现及检查结果综合判断。以下是常见的鉴别疾病及其特点：
1、溃疡性结肠炎
溃疡性结肠炎病变主要累及结肠和直肠，通常从直肠开始向上呈连续性分布，内镜下可见黏膜充血糜烂且病变表浅。而克罗恩病可侵犯全消化道，病变呈节段性跳跃分布，常伴有鹅卵石样改变或纵行溃疡，病理可见透壁性炎症或非干酪样肉芽肿。
2、肠结核
肠结核患者多有肺结核病史或结核接触史，病变好发于回盲部，病理检查可见干酪样坏死性肉芽肿，抗酸染色可能发现结核杆菌。克罗恩病的肉芽肿为非干酪样，且结核菌素试验或γ-干扰素释放试验结果有助于鉴别。
3、肠淋巴瘤
肠淋巴瘤多见于中老年人群，病变部位肠壁弥漫增厚，CT检查可见肠系膜淋巴结肿大但较少出现狭窄或瘘管。克罗恩病以青年患者为主，常伴肠腔狭窄、穿透性病变，病理活检可见淋巴细胞浸润但无淋巴瘤特异性标志物。
若出现反复腹痛、腹泻、体重下降等症状，建议尽早进行结肠镜检查、病理活检及影像学检查。医生会根据病变分布特征、病理结果以及血液学检测综合判断，必要时通过诊断性抗结核治疗辅助鉴别。确诊后需遵医嘱规范治疗并定期随访。