腘窝囊肿患者通常可以挂骨科、运动医学科、普外科或疼痛科等科室就诊，具体需根据病情选择。若囊肿体积较小且无明显症状，也可先到骨科初诊评估。
1、骨科
骨科主要处理骨骼、关节及周围组织的疾病。腘窝囊肿常与膝关节退行性变、半月板损伤等骨关节病变相关，骨科医生可通过查体、超声或磁共振检查明确诊断，并制定药物治疗或手术切除方案。
2、运动医学科
该科室专注于运动系统损伤和退行性病变。若腘窝囊肿由运动损伤、韧带劳损或慢性关节炎症引发，运动医学科医生可进行关节腔穿刺抽液、药物注射等微创治疗，同时指导康复锻炼。
3、普外科
当囊肿体积较大、压迫神经血管或合并感染时，可能需要普外科介入处理。外科医生会根据囊肿性质选择穿刺抽吸、囊肿切除等术式，术后进行抗感染治疗和伤口护理。
4、疼痛科
若囊肿引起持续性疼痛或活动受限，疼痛科可提供神经阻滞、物理治疗等缓解症状。但疼痛科通常作为辅助科室，需结合其他科室进行病因治疗。
就诊前建议携带既往检查报告、影像资料等，帮助医生快速判断囊肿性质。若出现膝关节红肿热痛、下肢麻木等伴随症状，需尽快就医排查是否存在关节感染或神经压迫等情况。