肛瘘不存在某种药物可以达到最有效的治疗效果，通常需要根据病情严重程度采取药物或手术治疗。常见的治疗方式包括抗生素治疗、止痛药物、局部药物治疗、中药治疗以及手术治疗等，需由医生评估后选择合适方案。
1、抗生素治疗
肛瘘继发感染时可引发红肿、疼痛等症状，需遵医嘱使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊、甲硝唑片等抗生素控制炎症。这类药物能抑制细菌繁殖，缓解局部感染，但无法根治瘘管。
2、止痛药物
若肛瘘导致明显疼痛，可短期服用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等非甾体抗炎药缓解症状。此类药物通过抑制前列腺素合成减轻疼痛，但长期使用可能引起消化道不适。
3、局部药物治疗
在医生指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等外涂患处，可减少分泌物并促进创面愈合。局部用药需配合肛周清洁护理，避免继发感染。
4、中药治疗
部分患者可遵医嘱使用复方角菜酸酯栓等中成药栓剂辅助治疗，其具有收敛止血作用，但需注意中药不能替代手术根治。
5、手术治疗
高位或复杂性肛瘘通常需行瘘管切开术、挂线疗法等手术，彻底清除瘘管组织。术后需定期换药并配合抗生素预防感染，多数患者预后良好。
肛瘘患者应及时到肛肠科就诊，通过肛门指诊或超声明确瘘管类型。药物治疗仅适用于感染期或术前准备，不可自行滥用抗生素。日常需保持肛周清洁干燥，避免久坐或进食辛辣食物，术后按医嘱进行扩肛护理以防复发。