冲调药物的水温需要根据药物类型来决定，一般不建议全部使用沸水冲泡。部分药物可能因高温导致成分破坏，而某些特定药物可能需要较高温度的水来促进溶解或释放药效。
冲调普通药物时，通常建议使用40℃~60℃的温水，这个温度既能帮助药物溶解，又不会破坏大部分药物的有效成分。例如益生菌制剂中的活菌在高温下容易失活，乳酶生、双歧杆菌三联活菌散等药物若用沸水冲服会显著降低疗效。冲泡中药颗粒剂时，部分品种如感冒清热颗粒需要沸水充分溶解，但具体应参照药品说明书。
冲泡特殊药物需特别注意水温控制。酶类药物如胃蛋白酶颗粒遇高温会变性失活，需用低于40℃的凉开水冲服。缓释制剂和肠溶片如硝苯地平控释片、阿司匹林肠溶片，若碾碎后高温冲服会破坏其特殊剂型结构，导致药物突释或胃黏膜刺激。需要特别注意的是，冲泡任何药物都不应使用超过80℃的热水，冲泡后需搅拌至完全溶解再服用。
建议在用药前仔细阅读药品说明书中的冲泡要求，对于标注需要热饮的中药颗粒剂，可待水温稍降后再服用。若对具体药物的冲调方式存在疑问，应及时咨询药师或处方医生，确保用药安全有效。储存药物时应注意防潮，已受潮结块的药物不宜继续使用。