扁平疣通常可以选择外用药物、免疫调节药物、抗病毒药物等进行治疗，患者需遵医嘱规范用药。临床常用药物包括咪喹莫特乳膏、维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏等，具体用药需根据病情严重程度选择。
1、咪喹莫特乳膏
该药属于免疫调节剂，通过刺激局部产生干扰素等细胞因子，增强机体对疣体病毒的免疫应答。使用时需薄涂于疣体表面，每周三次，可能出现红斑、糜烂等皮肤刺激反应，妊娠期女性禁用。
2、维A酸乳膏
能够调节表皮细胞分化，抑制疣体角质形成细胞过度增殖。建议晚间避光使用，涂抹后可能出现脱屑、灼热感等不良反应，哺乳期妇女及皮肤破损处慎用，治疗期间需加强防晒。
3、氟尿嘧啶软膏
通过干扰DNA合成抑制疣体细胞分裂，对顽固性疣体效果显著。使用时需精准点涂避免损伤正常皮肤，可能出现局部疼痛、色素沉着等副作用，肝肾功能异常者应谨慎使用。
除药物治疗外，还可配合冷冻治疗、激光治疗等物理疗法。患者应避免搔抓疣体以防自体接种扩散，保持患处清洁干燥。若用药后出现严重过敏反应或疣体持续增大，应及时前往皮肤科就诊，必要时进行组织病理学检查排除恶变可能。