鼻涕虫对人体健康的直接危害一般不大，但可能存在间接健康风险。这类软体动物本身不具有毒性，也不会主动攻击人类，但可能通过污染食物或传播寄生虫影响健康。
鼻涕虫体表的黏液接触人体皮肤后，部分敏感人群可能出现局部皮肤瘙痒、红肿等过敏反应，这种情况多见于儿童或过敏体质者。其体内可能携带广州管圆线虫的幼虫，这种寄生虫可通过未煮熟的中间宿主或污染蔬果进入人体，可能引发嗜酸性脑膜炎，临床表现为发热、头痛、颈部僵硬等症状。被鼻涕虫爬行污染的生鲜蔬菜、水果若未经充分清洗直接食用，可能摄入大肠杆菌、沙门氏菌等致病菌，导致胃肠道感染。
日常接触鼻涕虫后应及时用肥皂水清洗接触部位，处理瓜果蔬菜时建议先浸泡15分钟，再用流动清水冲洗。若食用被污染食物后出现持续腹痛、腹泻或神经系统症状，应及时到感染科就诊。在园艺活动中佩戴手套可有效减少接触风险，保持庭院干燥、清除潮湿杂物能减少其滋生环境。