咽口水时耳朵疼可能是咽鼓管功能异常、中耳炎或扁桃体炎等疾病因素引起，建议及时就医检查明确病因。若排除用力吞咽等生理性因素后，可能与以下疾病相关：
1、咽鼓管功能异常
感冒或过敏性鼻炎患者易出现鼻咽部黏膜肿胀，导致咽鼓管堵塞。此时进行吞咽动作时，空气无法通过咽鼓管进入中耳腔，造成耳内负压状态，牵拉鼓膜引发耳痛。这类患者常伴有耳闷胀感，可通过呋麻滴鼻液缓解鼻塞，配合桉柠蒎肠溶软胶囊促进黏液排出。
2、中耳炎
细菌或病毒感染中耳腔时，炎症刺激会引发持续性耳痛，吞咽动作会因肌肉牵拉加重疼痛感。急性期可能伴随发热、耳道流脓等症状，一般可遵医嘱使用头孢克肟分散片、阿莫西林克拉维酸钾片等抗生素，配合布洛芬缓释胶囊缓解疼痛。
3、扁桃体炎
急性化脓性扁桃体炎患者，炎症可能通过迷走神经耳支引发放射性耳痛。查体可见扁桃体充血肿大伴脓性渗出，治疗需使用注射用青霉素钠、罗红霉素胶囊等抗菌药物，配合复方氯己定含漱液进行局部消炎。
若耳痛持续超过48小时或伴随听力下降、耳道流脓等症状，建议及时到耳鼻喉科进行耳内镜检查和声导抗测试。日常应避免用力擤鼻，保持鼻腔通畅，乘坐飞机或潜水时可多做吞咽动作帮助平衡中耳压力。