毛霉菌感染的首选药物为两性霉素B及其脂质制剂，具体治疗方案需根据病情严重程度和患者个体情况制定。临床常用药物包括两性霉素B、泊沙康唑、艾沙康唑等，通常需联合手术清创及基础疾病治疗。
1、两性霉素B及其脂质制剂
作为一线用药，两性霉素B脂质体因毒性较低更适合长期使用。该药物通过与真菌细胞膜麦角固醇结合，导致细胞膜通透性增加而发挥杀菌作用。对于中枢神经系统感染，可能需要通过鞘内注射给药以提高局部药物浓度。
2、泊沙康唑或艾沙康唑
当患者无法耐受两性霉素B时，可选用泊沙康唑口服混悬液或艾沙康唑静脉制剂。这些三唑类药物通过抑制真菌细胞色素P450依赖性酶阻断麦角固醇合成，对部分毛霉菌菌株具有较好抑菌效果。治疗期间需监测血药浓度及肝功能指标。
3、手术清创治疗
对于鼻脑型毛霉菌病或局部组织坏死的患者，需在抗真菌治疗同时进行外科清创。手术应彻底清除坏死组织直至出现健康出血创面，必要时配合局部两性霉素B冲洗。对于眼眶受累病例可能需行眼球摘除术以阻止颅内蔓延。
该病死亡率可达50%以上，确诊后应立即开始治疗。建议在治疗过程中密切监测肾功能、电解质平衡，对于糖尿病患者需强化血糖控制。免疫抑制患者应酌情调整基础治疗方案，疗程通常需要持续至影像学病灶吸收和免疫状态恢复，平均治疗时间为6-12周。