尿道炎的治疗方法需根据病原体类型及患者具体情况选择，不存在效果最好的药物。通常可遵医嘱使用抗生素类药物如头孢克肟、左氧氟沙星、阿奇霉素，或配合三金片等中成药进行综合治疗。
1、头孢菌素类抗生素
头孢克肟片、头孢呋辛酯片等药物属于广谱抗生素，能有效抑制革兰氏阴性菌和部分阳性菌的细胞壁合成。此类药物对大肠埃希菌、淋球菌等常见尿道炎致病菌具有较强杀灭作用，且肝肾毒性相对较低，适用于单纯性尿路感染。
2、喹诺酮类抗生素
左氧氟沙星片、诺氟沙星胶囊等通过抑制细菌DNA旋转酶发挥作用，对铜绿假单胞菌等耐药菌株效果显著。需注意此类药物可能影响软骨发育，18岁以下青少年及孕妇慎用，用药期间需避免阳光直射。
3、大环内酯类抗生素
阿奇霉素片、克拉霉素片适用于衣原体、支原体引起的非淋菌性尿道炎，能穿透细胞膜作用于胞内病原体。对于青霉素过敏患者可作为替代方案，但需注意可能引起的胃肠道不适等副作用。
4、青霉素类抗生素
阿莫西林胶囊、氨苄西林胶囊对链球菌属和肠球菌效果较好，常与β-内酰胺酶抑制剂组成复方制剂增强疗效。用药前需进行皮试，治疗期间需监测过敏反应。
5、中成药辅助治疗
三金片、热淋清颗粒等具有清热利湿功效，可改善尿频、尿急症状。但需注意此类药物不能替代抗生素，应与抗菌药物联合使用，服用期间需保持充足水分摄入。
建议出现尿痛、尿急等症状时及时进行尿常规、细菌培养及药敏试验。用药需严格遵循医嘱完成疗程，避免自行停药导致耐药性产生。治疗期间应保持每日2000ml以上饮水量，避免辛辣刺激饮食，注意会阴部清洁卫生。性传播感染者需性伴侣同治，治疗期间禁止性生活。