粪菌移植在治疗某些肠道疾病中表现出一定效果，但具体疗效因疾病类型和个体差异而有所不同。该疗法对复发性艰难梭菌感染的效果较为明确，而对炎症性肠病、肠易激综合征等疾病的疗效仍需进一步研究。
1、复发性艰难梭菌感染
粪菌移植对艰难梭菌感染引起的伪膜性肠炎具有显著疗效，尤其是对抗生素治疗无效的复发病例。临床数据显示，单次移植的成功率可达85%-90%，能快速恢复肠道菌群平衡，抑制致病菌过度繁殖。其作用机制主要是通过引入健康供体的肠道微生物，重建患者肠道微生态。
2、其他肠道疾病
对于溃疡性结肠炎、克罗恩病等炎症性肠病，部分研究显示粪菌移植可改善腹痛、腹泻等症状，但缓解率和维持时间差异较大。在肠易激综合征治疗中，约有30%-50%患者报告症状减轻，但目前缺乏大样本长期随访数据支持。这些疾病的复杂发病机制导致疗效存在较大个体差异。
3、潜在风险与局限性
约10%-20%患者可能出现短暂腹胀、腹痛等消化道反应，严重并发症如肠穿孔发生率低于1%。供体筛选不严格可能导致病原体传播，免疫功能低下者存在感染风险。此外，移植途径（结肠镜、鼻肠管或胶囊）、供体选择标准等因素都会影响最终疗效。
进行粪菌移植前需完善肠镜等检查评估适应症，选择经严格筛查的健康供体。治疗应在具备资质的医疗机构开展，术后需密切监测肠道症状变化和菌群定植情况。患者不可自行尝试类似疗法，治疗方案的制定应遵循消化科医师的专业指导。