自慰过度一般不会导致阴茎严重损伤，但可能引起暂时性不适或轻微擦伤。阴茎的生理结构具有一定的耐受性，适度的自慰属于正常生理行为，通常不会造成器质性损伤。但频繁或粗暴的自慰方式可能引发局部组织反应。
自慰时反复摩擦可能导致阴茎皮肤表层出现轻微擦伤或红肿，这与皮肤受到机械刺激有关。通常这类损伤具有自限性，适当休息后可自行恢复。若操作过于剧烈，可能引起包皮系带撕裂，但这种情况较为少见，且常伴有明显疼痛或出血。此外，长期过度自慰可能使阴茎处于持续充血状态，可能诱发非器质性的敏感度增加或暂时性勃起不适。
若自慰后出现持续疼痛、肿胀或异常分泌物，需警惕感染的可能性。日常应注意保持适度频率，建议使用润滑剂减少摩擦，避免使用不当工具或施加过大压力。出现持续性不适或肉眼可见的创伤时，应及时到泌尿外科就诊检查，排除其他器质性疾病可能。