肠胃镜检查一般需要挂消化内科、普通外科或内镜中心，具体需根据医院科室设置而定。不同医院的分科可能存在差异，建议结合自身症状和就诊医院的情况选择。
1、消化内科
消化内科是进行胃镜、肠镜检查的主要科室，主要针对消化道炎症、溃疡、息肉等疾病进行检查和治疗。若患者存在反酸、腹痛、便血等消化道症状，或需进行常规胃肠癌筛查，通常建议首选消化内科就诊。部分医院消化内科医生可直接操作内镜并出具诊断报告。
2、普通外科
当胃肠镜检查发现需要外科干预的情况时，如消化道穿孔、肠梗阻或肿瘤病变等，可能需要转至普通外科进一步治疗。若患者已明确存在需手术治疗的疾病（如急性阑尾炎），部分医院会建议直接挂普通外科，由外科医生评估是否需术前内镜检查。
3、内镜中心
大型综合医院或专科医院常设立独立的内镜中心，配备专业设备和医护人员，可一站式完成预约、检查及简单治疗。这类中心通常不单独设挂号科室，需通过首诊医生开具检查单后，直接在内镜中心预约具体检查时间。
建议就诊前通过医院官网、挂号平台查询具体科室设置，或直接咨询医院导诊台。检查前需遵医嘱进行肠道准备，如禁食禁水、服用清肠药物等。若有严重心肺疾病或凝血功能障碍等特殊情况，应提前告知医生评估检查风险。