孢子阳性通常提示样本中检测到了真菌孢子，可能为正常定植或感染，需结合其他检查综合判断。这种情况可能出现在痰液、分泌物或组织活检中，具体意义因检测部位和个人健康状况而异。
1、正常定植
人体某些部位如口腔、肠道可能存在少量真菌孢子，属于正常菌群的一部分。若免疫功能正常且无感染症状，通常无需特殊处理。例如口腔念珠菌定植常见于健康人群。
2、真菌感染
免疫低下人群可能出现侵袭性真菌感染，如肺孢子菌肺炎常见于艾滋病患者，孢子阳性伴随发热、咳嗽等症状时具有诊断价值。血液病患者骨髓移植后曲霉菌孢子阳性可能提示侵袭性感染。
3、浅表感染
阴道分泌物检出真菌孢子常提示念珠菌性阴道炎，伴有豆腐渣样白带和瘙痒。皮肤刮片发现孢子可能为体癣或股癣，多伴随环形红斑和脱屑。
诊断需结合临床表现和其他实验室检查，如血清G试验、GM试验可辅助诊断侵袭性真菌病。组织病理学发现菌丝侵入组织是确诊金标准。免疫功能正常者若仅孢子阳性而无症状，通常建议观察；出现发热、咳血等症状时应立即进行CT等影像学检查。所有疑似深部真菌感染者都需在感染科医生指导下规范治疗，避免擅自使用抗真菌药物。