莲子百合汤作为传统药膳，一般具有健脾止泻、养心安神、润肺止咳、滋阴润燥以及增强体质等功效。但由于其食材性质偏寒凉，可能引起脾胃虚寒、消化不良或过敏等副作用。
1、健脾止泻
莲子含有生物碱及棉子糖成分，中医认为其能补益脾气，固涩肠道，对于脾虚引起的腹泻、食欲不振有一定缓解作用。
2、养心安神
百合中含百合苷等镇静成分，配合莲子的养心作用，可改善心悸失眠、焦虑烦躁等心神不宁症状。
3、润肺止咳
百合的黏液质能润泽肺阴，对干咳少痰、咽喉干燥等肺燥症状有缓解效果，适合秋季燥邪伤肺时食用。
4、滋阴润燥
汤品中百合性微寒，莲子味甘涩，二者协同能补充阴液，改善口干舌燥、皮肤干燥等阴虚内热表现。
5、增强体质
莲子富含蛋白质和钾元素，百合含多糖类物质，适量食用可为机体补充营养，辅助提升免疫力。
可能出现的副作用主要包括：脾胃虚寒者过量饮用易引发腹痛腹泻；莲子淀粉含量较高，消化功能弱者可能出现腹胀；个别体质敏感者可能对百合中的秋水仙碱产生过敏反应。建议湿热体质者适量食用，虚寒体质者可加入生姜调和，出现皮疹或消化道不适时应立即停用并就医。