囊肿通常不会发展成肿瘤。绝大多数囊肿是良性病变，其形成多与液体潴留、感染或先天性因素有关，与肿瘤的发生机制不同。但极少数情况下，某些特殊类型的囊肿可能与肿瘤存在一定关联，需结合具体类型和病理特征判断。
囊肿与肿瘤的本质区别在于组织结构。囊肿内部多为液体或半流体物质，外层由囊壁包裹，通常生长缓慢且边界清晰，例如肝囊肿、肾囊肿等。而肿瘤是细胞异常增殖形成的实体团块，可能侵犯周围组织或转移。目前医学研究未发现普通良性囊肿直接恶变为肿瘤的证据。
极少数情况下，部分囊肿可能合并潜在恶变风险。例如卵巢囊腺瘤存在一定概率发展为囊腺癌，胰腺黏液性囊腺瘤也可能有低度恶性倾向。此类情况通常需要病理活检确诊，并需通过影像学动态观察囊肿形态变化。
若发现囊肿体积短期内迅速增大、囊壁增厚或不规则、内部出现实性成分等情况，建议及时就医完善检查。日常生活中应避免对囊肿部位进行按压或外力冲击，并遵医嘱定期复查，以便早期发现异常变化。