穿刺活检过程中通常会进行局部麻醉，因此多数患者不会感到剧烈疼痛，但可能存在轻微不适感或短暂疼痛。具体感受因个人耐受力、操作部位及麻醉效果而异。
进行穿刺活检时，医生会在穿刺点注射局麻药物，麻醉生效后穿刺痛感通常较轻微。部分人可能感受到皮肤被刺入的瞬间压力或牵拉感，但多数可以耐受。活检后可能出现短暂隐痛或酸胀，一般1~2天内逐渐缓解。若进行深部组织活检（如肝脏、肺部），术后疼痛可能略明显，但通常不会影响日常活动。
对疼痛敏感、精神紧张或需多次穿刺的患者，痛感可能更显著。此外，凝血功能异常者术后可能出现血肿引发胀痛。建议检查前与医生充分沟通，必要时可遵医嘱使用镇痛药物。术后按医嘱压迫止血并观察穿刺部位，出现持续剧痛或红肿需及时就诊。