结膜炎患者一般可以遵医嘱使用抗感染药物、抗过敏药物、人工泪液、糖皮质激素以及冷敷等方式进行治疗。由于病因不同，具体用药需根据医生诊断选择，避免自行用药加重病情。
1、抗感染药物
病毒性结膜炎常用阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液等抗病毒药物；细菌性结膜炎可使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等抗生素；衣原体感染可选用红霉素眼膏或口服阿奇霉素片进行病原体清除。
2、抗过敏药物
过敏性结膜炎患者需应用色甘酸钠滴眼液、奥洛他定滴眼液等抗组胺药物，严重者可短期使用普拉洛芬滴眼液等非甾体抗炎药。春季角结膜炎患者可能需要环孢素滴眼液等免疫抑制剂。
3、人工泪液
玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等可缓解干眼症状，冲刷眼表过敏原，适用于长期电脑工作者或伴有干眼症的患者。需选择不含防腐剂的剂型，每日使用4-6次。
4、糖皮质激素
氟米龙滴眼液、地塞米松滴眼液等适用于重度过敏性结膜炎或合并角膜浸润的情况。使用时需严格监测眼压，连续使用不超过2周，疱疹性结膜炎患者禁用。
5、冷敷治疗
急性期用4℃无菌生理盐水浸湿纱布冷敷，每次10-15分钟，每日3-4次。可收缩血管减轻充血，降低神经末梢敏感性，但需注意避免交叉感染。
结膜炎患者应及时到眼科进行分泌物培养和过敏原检测。用药期间需注意单独使用眼药，避免接触眼瓶口造成污染。佩戴隐形眼镜者应暂停使用，伴有全身症状者需配合口服药物治疗。若出现视力下降、眼痛加剧等情况需立即复诊，糖尿病患者慎用激素类眼药。