乙肝病毒e抗原阴性通常表示病毒复制活动较低或处于免疫控制阶段，可能涉及病毒感染恢复期、治疗后免疫控制或病毒变异等情况，需结合其他指标综合判断。具体原因可能包括病情阶段、治疗效果以及病毒变异等因素，建议就医进一步检查。
1、病毒感染阶段
在乙肝病毒感染后的恢复期或慢性乙肝非活动期，e抗原可能转阴并伴随e抗体出现。此时病毒复制水平较低，肝脏炎症较轻，传染性较弱。但部分患者仍可能存在低水平病毒复制，需定期监测肝功能和病毒载量。
2、治疗后免疫控制
经过规范的抗病毒治疗后，如使用恩替卡韦、替诺福韦等药物，病毒复制受到抑制，e抗原可发生血清学转换。这种情况通常提示治疗应答良好，但需要继续维持治疗，擅自停药可能导致病毒反弹。
3、病毒前C区变异
部分乙肝病毒株发生基因变异后，虽然e抗原检测呈阴性，但病毒仍在活跃复制（HBV-DNA阳性）。这种情况常见于HBeAg阴性慢性乙型肝炎，病情可能更隐匿，肝纤维化进展风险较高，需通过高灵敏度DNA检测确认。
若乙肝五项检测显示e抗原阴性，建议完善HBV-DNA定量、肝功能、肝脏超声等检查。对于病毒载量持续阳性者，即使e抗原阴性也需考虑抗病毒治疗。日常应注意避免饮酒、规律作息，每3-6个月复查相关指标，由感染科医生评估病情进展和治疗方案。