肠镜检查在规范操作的前提下通常是安全的，但少数情况下可能存在一定的风险。该检查由专业医生完成，严重并发症发生率较低，多数受检者仅会出现轻微不适。
肠镜检查前会进行全面的评估，医生会排除禁忌证并制定个体化方案。检查过程中使用的内镜设备经过严格消毒，能够有效避免交叉感染。操作时医生会通过注气、牵拉等手法充分暴露肠腔，轻柔推进内镜减少黏膜损伤。约0.1%-0.3%的受检者可能出现肠穿孔，多发生在肠道本身存在严重病变或操作难度较大的情况。0.1%左右的出血风险主要与息肉切除等治疗操作相关，单纯检查出血概率更低。
检查后腹胀、肛门不适等症状通常在数小时内自行缓解。选择三级医院或消化专科医院进行检查，能获得更专业的操作保障。检查前三天应遵医嘱调整饮食，正确服用肠道准备药物确保视野清晰。若术后出现持续腹痛、便血或发热等情况，应及时返院就诊。对于高龄、心肺功能不全等特殊人群，医生会提前进行多学科会诊评估风险。