肺炎支原体阴性通常代表受检者的血液、痰液或咽拭子等样本中未检测到肺炎支原体的特异性抗体、抗原或核酸，可能提示未感染该病原体。但需结合临床表现和其他检查结果综合判断。
1、未感染肺炎支原体
若患者无咳嗽、发热等呼吸道症状，且影像学检查无异常，阴性结果可能说明体内不存在活动性感染。此时无需特殊治疗，可正常生活。
2、检测时间过早
感染初期（1周内）抗体尚未形成，血清学检测可能出现假阴性。例如IgM抗体通常在感染后7-10天才能被检出，核酸检测在发病4天内阳性率最高。建议症状持续者间隔1-2周复查。
3、样本或检测方法影响
咽拭子采集不到位、样本保存不当或检测试剂灵敏度不足可能导致假阴性。例如核酸检测的准确率约85-95%，而抗体检测受个体免疫应答差异影响。部分使用大环内酯类抗生素治疗的患者，病原体载量下降也会影响检出率。
该结果需由医生结合血常规、胸部CT等检查综合评估。若出现持续干咳、夜间加重伴头痛等症状，即使检测阴性也建议复诊。避免自行服用抗生素，以免干扰后续检测或导致耐药性。