肛肠疾病通常属于肛肠科、普外科或消化内科，具体需根据疾病类型及症状选择科室。若存在肛门直肠局部病变或需手术治疗，建议到肛肠科或普外科就诊；若为肠道功能性问题，可考虑消化内科。
1、肛肠科
肛肠科专门诊治肛门、直肠及周围组织的疾病，如痔疮、肛裂、肛周脓肿、肛瘘等。这类科室医生熟悉肛门局部解剖结构，擅长通过指检、肛门镜等检查明确病变性质，并开展微创手术或传统外科治疗。对于肛门疼痛、便血、肿块脱出等症状，建议首选肛肠科就诊。
2、普外科
部分医院未单独设立肛肠科时，肛肠疾病常由普外科负责诊治。普外科处理范围更广，包括肠道肿瘤、肠梗阻、急性阑尾炎等疾病。若肛肠疾病合并腹部症状（如腹痛、腹胀）或需复杂手术，普外科可提供综合治疗。肛周蜂窝织炎、坏死性筋膜炎等严重感染性疾病也需在此科室处理。
3、消化内科
对于炎症性肠病（溃疡性结肠炎、克罗恩病）、肠易激综合征等以腹泻、黏液便、里急后重为主要症状的功能性或炎症性肠道疾病，消化内科可通过肠镜、粪便检测等手段进行诊断，并给予药物调控、营养支持等系统性治疗。
患者可根据症状初步判断就诊方向，但部分疾病存在交叉表现（如直肠癌可能同时出现便血和排便习惯改变）。若无法明确分科，建议先至医院分诊台咨询，必要时多学科联合会诊。就诊时需详细描述症状持续时间、诱发因素及伴随症状，配合医生完成肛门指检、肠镜等检查以便精准治疗。