胃窦溃疡是否严重需根据具体情况判断。多数患者经过规范治疗可以改善，但如果出现并发症或延误治疗，可能发展为较严重的健康问题。
胃窦溃疡的严重程度与溃疡深度、是否伴有出血或穿孔等因素有关。较小的浅表溃疡通过抑酸、保护胃黏膜等治疗通常预后较好。若溃疡侵蚀到血管可能导致呕血、黑便等消化道出血症状。当溃疡穿透胃壁全层时可能引发急性腹膜炎，出现剧烈腹痛、板状腹等急症表现。
幽门附近的溃疡反复发作可能形成瘢痕性狭窄，造成幽门梗阻，出现反复呕吐、营养不良等问题。长期不愈的胃窦溃疡存在一定癌变风险，特别是伴有幽门螺杆菌持续感染的患者，需定期进行胃镜复查和病理活检。
日常应注意规律饮食，避免过饥过饱，减少辛辣、浓茶、咖啡等刺激性食物摄入。出现持续上腹痛、体重下降、贫血等症状时应及时就诊消化科，通过胃镜检查明确溃疡性质，遵医嘱使用奥美拉唑、铝碳酸镁、胶体果胶铋等药物治疗，幽门螺杆菌阳性者需规范进行四联疗法根除治疗。