真菌感染的治疗方法包括外用药物、口服药物、日常护理、综合治疗以及中医辅助治疗等，能否根除需根据感染类型、治疗规范性和个体免疫力等因素综合判断。多数患者通过规范治疗可有效控制病情，但部分复杂感染易复发。
1、外用药物
适用于局部浅表性真菌感染，如手癣、足癣等。常用酮康唑乳膏、联苯苄唑乳膏等抗真菌药膏，能直接抑制真菌细胞膜合成。使用时需清洁患处后涂抹，疗程通常持续2-4周，需在症状消失后继续用药1周巩固疗效。
2、口服药物
针对顽固性或全身性感染如甲癣、深部真菌病。氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊等口服抗真菌药通过肝脏代谢，可能影响肝功能，用药期间需定期监测肝酶指标。疗程根据感染部位差异较大，指甲真菌感染常需3-6个月持续治疗。
3、日常护理
保持患处干燥透气，每日更换纯棉袜并煮沸消毒。避免共用拖鞋、毛巾等个人物品，公共场所接触后及时用硫磺皂清洗。控制血糖对糖尿病患者尤为重要，高血糖环境易致真菌复发。
4、综合治疗
重症患者如真菌性败血症需住院接受两性霉素B静脉给药，联合氟胞嘧啶增强疗效。反复发作的皮肤癣菌病可配合308nm准分子激光治疗，利用特定波长光波破坏真菌结构。
5、中医辅助治疗
土槿皮酊、复方黄柏液等中药制剂具有燥湿杀虫作用，可辅助改善体癣症状。但需注意中药不能替代抗真菌药物，使用前应咨询中医师辨证施治。
治疗期间应严格遵医嘱完成全程治疗，擅自停药易产生耐药性。保持贴身衣物高温烫洗，避免抓挠防止自身接种传播。免疫力低下者可适当补充维生素B族和锌元素，增强皮肤屏障功能。若治疗2周未见改善或出现红肿化脓，应及时复诊调整方案。