犬巴贝斯虫病的治愈几率通常与感染的虫种、治疗及时性以及患病犬只的整体健康状况有关。多数情况下，若早期发现并规范治疗，治愈率可达70%~90%，但出现严重并发症或免疫力低下时可能影响预后。
1、感染虫种
不同巴贝斯虫的致病性存在差异。例如犬巴贝斯虫感染相对容易控制，而吉氏巴贝斯虫可能引发更严重的溶血性贫血，导致治疗难度增加，治愈率可能下降至50%~70%。
2、治疗及时性
在感染初期（出现发热、食欲减退等症状时）立即使用阿奇霉素、克林霉素等抗原虫药物，可有效抑制虫体繁殖。若延误至出现血红蛋白尿、黄疸等严重症状，可能并发急性肾损伤，此时治愈几率显著降低。
3、犬只免疫力
免疫系统健全的成年犬通过规范用药和输血支持，通常预后较好。幼犬、老年犬或患有免疫抑制性疾病（如犬瘟热）的个体，由于机体清除病原能力不足，易发展为慢性感染或复发，可能需要长达数月的间歇治疗。
确诊后应严格遵循兽医师制定的治疗方案，定期复查血液涂片和PCR检测。治疗期间需加强营养支持，保持环境清洁并做好体外驱虫，避免再次被蜱虫叮咬导致重复感染。若出现治疗抵抗情况，应及时调整药物组合方案。