清肺并不存在所谓的“最佳药物”，具体用药需根据咳嗽、痰多、气喘等不同症状以及病因进行选择。常见药物包括清肺化痰类中成药、抗感染西药、支气管扩张剂等，需在医生指导下使用。
清肺化痰类中成药适用于外感风热或痰热壅肺的情况，如清肺消炎丸可缓解黄痰咳嗽，养阴清肺口服液适用于干咳少痰的肺阴虚证，百合固金片对久咳痰血有效。这类药物多含浙贝母、麦冬等中药成分，具有润燥止咳作用。抗感染药物主要针对细菌性肺炎或支气管炎，常用阿莫西林胶囊、头孢克肟片、左氧氟沙星片等，但需通过血常规检查确认感染类型再使用。支气管扩张剂如氨茶碱片、硫酸沙丁胺醇气雾剂，能快速缓解气道痉挛引发的呼吸困难。
对于职业性尘肺或长期吸烟者，需配合克矽平雾化吸入抑制肺纤维化。日常应保持每天2000ml饮水量稀释痰液，使用空气净化器控制PM2.5浓度低于35μg/m³。若持续咳嗽超过2周或出现血痰，应及时进行胸部CT检查。药物使用需严格遵医嘱，自行用药可能导致菌群失调或掩盖病情，特别是抗生素滥用易产生耐药性。