尖锐湿疣没有绝对的最佳治疗方法，通常需根据疣体大小、数量及患者个体情况选择适合的方案，常见方法包括药物治疗、物理治疗、手术治疗、光动力治疗以及免疫治疗等。
1、药物治疗
适用于体积较小、数量较少的疣体。患者可遵医嘱外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊或重组人干扰素α-2b凝胶等药物，通过抑制病毒增殖或调节局部免疫反应促进疣体消退。用药期间需注意局部皮肤反应，如出现严重红肿需暂停使用。
2、物理治疗
包括液氮冷冻、激光或电灼等方式。液氮冷冻通过低温使疣体组织坏死脱落，适用于生殖器、肛周等部位的皮损；二氧化碳激光可精准汽化疣体，创面恢复较快。治疗后需保持创面清洁，预防继发感染。
3、手术治疗
针对体积较大、基底较宽的疣体，可通过手术切除彻底去除病灶。术后需进行病理检查确认病变性质，并配合其他疗法降低复发风险。
4、光动力治疗
将光敏剂外敷后采用特定波长光照，选择性破坏病毒感染细胞。尤其适用于尿道口、宫颈管等特殊部位，具有创伤小、复发率低的优势。
5、免疫治疗
对于反复发作或顽固性病例，可联合使用干扰素、白介素等免疫调节剂，通过增强机体细胞免疫功能抑制HPV病毒活性。部分患者需配合口服胸腺肽等药物进行系统调节。
该疾病具有传染性，治疗期间应避免性接触，性伴侣需同步检查。治疗后需定期复查3-6个月，观察是否有复发迹象。日常注意保持外阴清洁干燥，避免使用刺激性洗剂，加强体育锻炼有助于提高免疫力。所有治疗方案均需在皮肤科医生指导下进行，切忌自行购药处理。