山慈菇作为中药材，可能引起胃肠道不适、过敏反应、肝肾损伤等副作用，需遵医嘱规范使用。其药性偏寒，长期或过量使用可能加重身体负担，特殊人群应谨慎使用。
1、胃肠道不适
山慈菇性寒，可能刺激胃肠道黏膜，导致恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状。脾胃虚寒或消化功能较弱的人群更易出现此类反应，建议饭后服用以减轻刺激。
2、过敏反应
部分患者可能对山慈菇中的生物碱等成分过敏，表现为皮肤瘙痒、红疹、荨麻疹，严重时可出现呼吸困难或过敏性休克。首次使用建议进行过敏测试，出现异常立即停药。
3、肝肾损伤
山慈菇含秋水仙碱等有毒成分，长期大剂量使用可能引起肝肾细胞损伤，表现为尿量异常、黄疸、转氨酶升高等。慢性肝肾疾病患者需严格遵循剂量限制，用药期间建议定期监测肝肾功能。
特殊人群如孕妇、哺乳期妇女及儿童应慎用，避免影响胎儿发育或引发幼儿中毒。山慈菇需配伍使用且疗程不宜超过2周，出现严重不良反应时应立即就医。使用前建议由中医师辨证施治，避免自行采挖不明来源的药材。