木耳过量食用可能引起消化不良、细菌毒素中毒、凝血功能异常、过敏反应以及加重代谢负担等危害。日常需注意控制摄入量，避免不当泡发或烹饪方式导致健康风险。
过量食用木耳可能导致膳食纤维摄入过多，刺激胃肠道并影响消化吸收功能。木耳中的纤维素难以被人体完全分解，大量堆积在肠道内易引发腹胀、腹痛或腹泻等不适症状。对于胃肠功能较弱的人群，如老年人或慢性胃病患者，症状可能更为明显。
木耳浸泡时间超过6小时可能滋生椰毒假单胞菌，该菌产生的米酵菌酸毒素耐高温且毒性强。中毒症状常在食用后2-24小时出现，表现为恶心呕吐、黄疸、血尿等症状，严重时可引发多器官衰竭甚至死亡。2020年广东某家庭因食用泡发三天的凉拌木耳导致多人中毒事件，凸显正确泡发的重要性。
木耳中含有的腺苷类物质具有抑制血小板聚集的作用。对于正在服用华法林、阿司匹林等抗凝药物的患者，过量摄入可能增强药物效果，增加异常出血风险。临床建议此类人群每日食用量不超过50克，且需与用药时间间隔2小时以上。
建议日常食用干木耳控制在10-15克（泡发后约100-150克），温水泡发不超过2小时，烹饪前充分清洗。出现食用后不适症状应立即停止摄入，若出现严重中毒表现需及时就医处理。特殊人群食用前应咨询专业医师或营养师建议。