黄连素作为常用药物，可能引起胃肠道不适、过敏反应、肠道菌群紊乱、肝功能异常以及药物相互作用等副作用。其常见副作用具体如下：
1、胃肠道不适
部分患者服用后可能出现恶心、呕吐、腹胀或腹痛等消化道症状。这通常与药物对胃黏膜的局部刺激有关，建议餐后服用以减轻不适感。
2、过敏反应
偶见皮肤瘙痒、红斑或荨麻疹等过敏表现，极少数可能发生过敏性休克。过敏体质者首次用药需密切观察，出现呼吸急促需立即停药就医。
3、肠道菌群紊乱
长期使用可能抑制肠道正常菌群，导致便秘、口腔念珠菌感染等继发性问题。临床数据显示连续用药超过7天者约有5%出现菌群失调症状。
4、肝功能异常
大剂量使用可能引起血清转氨酶升高，表现为乏力、食欲减退。建议肝功能不全者慎用，用药期间定期监测肝功指标。
5、药物相互作用
与降糖药合用可能增强降糖效应，引发低血糖风险；与环孢素同服会增加后者血药浓度。联合用药时应间隔2小时以上，并调整剂量。
使用黄连素需严格遵医嘱控制疗程，服药期间若出现黑便、持续头痛或心悸等异常症状，应及时就诊进行肝功能、血常规等检查。儿童、孕妇及哺乳期妇女应在医师指导下权衡利弊使用。