幽门螺杆菌的治疗药物主要包括抗生素类药物、质子泵抑制剂以及铋剂等，常见的如阿莫西林、克拉霉素、奥美拉唑、枸橼酸铋钾等，需遵医嘱联合使用。
1、抗生素类药物
阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑等抗生素可通过破坏细菌细胞壁或抑制蛋白质合成等方式杀灭幽门螺杆菌，其中阿莫西林属于β-内酰胺类抗生素，克拉霉素为大环内酯类药物，甲硝唑则对厌氧菌具有较强抗菌活性，联合用药可减少耐药性发生。
2、质子泵抑制剂
奥美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑等药物能不可逆地抑制胃壁细胞H+/K+-ATP酶，有效减少胃酸分泌，提高胃内pH值，为抗生素发挥作用创造适宜环境，同时缓解患者反酸、烧心等症状。
3、铋剂
枸橼酸铋钾、胶体果胶铋等铋剂可在胃黏膜表面形成保护层，减少胃酸对溃疡面的刺激，同时直接抑制幽门螺杆菌的酶系统和代谢，与抗生素联用可显著提高根除率。此类药物还能促进前列腺素分泌，加速黏膜修复。
治疗期间需严格按照医嘱足量、足疗程用药，避免自行增减剂量或停药。用药期间可能出现黑便、恶心等反应，若出现皮疹、严重腹泻等情况应及时复诊。完成治疗后建议间隔4周进行复查，评估根除效果。日常应注意分餐制，避免家庭成员交叉感染。