肠镜检查是否痛苦因人而异，通常普通肠镜可能会有轻微不适但可以忍受，而无痛肠镜基本不会感到痛苦。具体感受与个人耐受性、肠道准备情况及操作医生手法等因素有关。
普通肠镜过程中，部分人可能出现腹胀、腹痛等不适，主要由于肠镜在肠道内移动或充气引起。医生会指导患者调整呼吸以缓解不适，多数患者能够配合完成检查。无痛肠镜则通过静脉注射麻醉药物，使患者在睡眠状态下完成检查，整个过程无意识、无痛感，检查结束后可快速苏醒。
若对疼痛较敏感或存在肠粘连、肠道狭窄等情况，不适感可能加重，需提前告知医生评估是否适合普通肠镜。检查前需严格遵医嘱进行饮食控制及肠道清洁，避免残留物影响视野或增加操作难度。检查后可能出现短暂腹胀，适当走动后可逐渐缓解。若选择无痛肠镜，需家属陪同并禁食禁水足够时间，以降低麻醉风险。