会阴部发凉是否会影响生殖功能需要根据具体原因判断。一般情况下，生理性因素导致的暂时性发凉不会直接影响生殖功能，但病理性因素可能产生潜在影响。
1、生理性原因
寒冷环境刺激、久坐或穿着过紧衣物可能导致局部血液循环暂时性减慢，引起会阴部发凉。这种情况在改善环境或调整姿势后通常可自行缓解，不会对睾丸生精功能或生殖系统造成实质性损害。
2、病理性血液循环障碍
精索静脉曲张、动脉硬化等疾病会影响睾丸血液供应，导致局部温度调节异常。长期缺血可能影响精子生成环境，降低精子活力和质量，这类情况可能间接影响男性生育能力。
3、生殖系统炎症
慢性前列腺炎、附睾炎等疾病在引起会阴部温度异常的同时，可能伴随病原微生物感染。炎症因子释放可能影响精液成分，严重时可能造成输精管道堵塞，这种情况可能对生殖功能产生实质性影响。
4、激素水平异常
甲状腺功能减退、肾上腺皮质功能不全等内分泌疾病可能导致基础代谢率下降，出现全身性畏寒症状。这类激素紊乱可能影响性腺功能，干扰精子生成或卵泡发育过程。
建议保持会阴部清洁干燥，避免久坐和局部压迫。若伴随尿频、疼痛、性功能异常或持续超过两周未缓解，应及时到泌尿外科或男科就诊，通过阴囊彩超、性激素检测等检查明确病因。备孕人群出现此类症状建议尽早排查，以保障生殖健康。