磷酸二氢铵在规范使用的情况下对人体相对安全，但需根据具体接触方式和剂量进行判断。其安全性主要取决于应用场景、暴露量以及个体敏感程度等因素。
作为食品添加剂时，磷酸二氢铵需符合国家食品安全标准。在糕点、饼干等加工食品中，其功能主要为调节酸度或作为膨松剂成分，严格控制在每千克食品添加0.5-3克的范围内。在此标准内使用通常不会对人体造成明显危害，但过量摄入可能导致血磷升高，影响钙质吸收。在农业领域作为肥料使用时，直接接触高浓度粉末可能刺激呼吸道黏膜，引发咳嗽、咽喉不适等症状，操作时需佩戴防护装备。工业生产中若发生泄漏事故，大量吸入其气溶胶可能诱发化学性肺炎，皮肤长期接触浓溶液可能造成灼伤。
日常接触含磷酸二氢铵的日化产品或食品时，建议仔细阅读产品成分表。从事相关行业的人员应定期进行职业健康检查，出现眼部刺激症状需立即用清水冲洗15分钟。误食工业级产品后，应立即饮用牛奶或蛋清保护消化道黏膜，并携带产品包装及时就医。储存时应与强酸、强碱类物质分开放置，避免儿童接触。