免疫系统疾病能否彻底治愈需根据具体类型进行分析，多数情况下无法完全根治但可有效控制。例如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等自身免疫病通常需要长期治疗，而部分继发性免疫缺陷病可能通过消除诱因缓解病情。
1、自身免疫性疾病
此类疾病因免疫系统异常攻击自身组织导致，如类风湿关节炎和系统性红斑狼疮。目前尚无根治方法，但通过甲氨蝶呤片、来氟米特片等抗风湿药物，配合糖皮质激素治疗，约70%患者可实现病情缓解。
2、原发性免疫缺陷病
这类遗传性疾病如X连锁无丙种球蛋白血症，因基因缺陷导致免疫功能不全。虽然造血干细胞移植可能重建部分免疫功能，但存在配型困难和排异风险，多数患者需终身接受免疫球蛋白替代治疗。
3、继发性免疫缺陷病
由感染、药物或恶性肿瘤等诱发的免疫功能障碍，如艾滋病或化疗后免疫力低下。通过抗病毒治疗、停用相关药物或肿瘤控制后，约35%-50%患者的免疫功能可逐渐恢复至接近正常水平。
免疫系统疾病患者需定期监测炎症指标和免疫功能，在风湿免疫科医师指导下调整治疗方案。生物制剂等新型靶向药物的发展显著提高了疾病控制率，规范治疗可使多数患者获得长期生存和良好生活质量。