脑干梗死可能导致运动功能障碍、感觉异常、平衡障碍、吞咽困难以及呼吸功能障碍等后遗症。具体后遗症的严重程度与梗死部位和范围密切相关，需及时治疗干预。
1、运动功能障碍
脑干梗死常累及锥体束，导致对侧肢体偏瘫或四肢瘫，表现为肌力下降、活动受限。若累及脑神经核团，可能出现面瘫、眼球活动障碍等，严重影响日常行动能力。
2、感觉异常
病变若影响内侧丘系或三叉神经感觉核，可出现对侧躯体麻木、痛温觉减退，部分患者伴随面部感觉异常，甚至出现神经性疼痛。
3、平衡障碍
小脑脚或前庭神经核受损时，患者会出现眩晕、站立不稳、步态蹒跚等共济失调表现，容易跌倒导致二次损伤。
4、吞咽困难
延髓病变可能损伤舌咽、迷走神经核，导致吞咽反射减弱，出现饮水呛咳、进食困难，严重者需鼻饲饮食，且易并发吸入性肺炎。
5、呼吸功能障碍
若梗死波及延髓呼吸中枢，可能出现呼吸节律异常、呼吸暂停，甚至需要气管插管和机械通气支持，属于危急重症。
脑干梗死后遗症需在发病早期通过溶栓或取栓治疗尽可能减少神经损伤。恢复期应遵医嘱进行肢体康复、吞咽功能训练及平衡练习，同时控制高血压、糖尿病等基础疾病，定期复查头颅影像学评估恢复情况。