脑干损伤后能否完全恢复需根据损伤程度进行判断，通常轻度损伤可能恢复较好，而重度损伤则预后较差。脑干作为生命中枢，负责调节呼吸、心跳等重要功能，其损伤后的恢复情况与损伤范围和治疗时机密切相关。
1、轻度损伤
若脑干损伤程度较轻，如局部水肿或少量出血，及时进行脱水降颅压、神经营养等治疗，部分患者神经功能可能逐渐恢复。此时通过积极治疗和康复训练，有可能达到较好的恢复效果，但仍可能遗留轻微后遗症。
2、重度损伤
当发生脑干大量出血、弥漫性轴索损伤或脑干梗死时，神经元出现不可逆坏死。这类损伤即使通过呼吸机支持、亚低温治疗等措施维持生命体征，通常也难以恢复受损的神经功能，患者可能长期处于昏迷或植物生存状态。
3、继发性损伤
在原发性损伤基础上，若出现颅内感染、脑积水或癫痫持续状态等并发症，可能加重神经功能缺损。这种情况下恢复的可能性会进一步降低，需通过脑室引流、抗感染等综合治疗控制病情进展。
脑干损伤患者应尽早在重症监护室进行生命支持治疗，损伤后6个月内是康复黄金期。建议在病情稳定后，通过高压氧、针灸及运动疗法等综合康复手段促进神经功能代偿，但需注意严重损伤患者的功能恢复存在较大局限性，需做好长期护理准备。