遗传因素可能通过遗传性疾病、基因突变或代谢缺陷等途径影响脑萎缩的形成。这类因素通常与特定的基因异常有关，可能干扰神经细胞的正常功能或结构，最终导致脑组织萎缩。
1、遗传性疾病
亨廷顿病、遗传性共济失调等单基因显性遗传病会直接引发神经元退行性改变。这些疾病的致病基因如HTT基因突变会导致基底节区神经元凋亡，患者可能出现运动失调、认知功能下降等症状。临床常用丁苯那嗪、氘代丁苯那嗪等药物缓解运动障碍。
2、基因突变
阿尔茨海默病相关的APP、PSEN1等基因突变会促进β淀粉样蛋白沉积，损伤海马和皮层神经元。额颞叶痴呆相关的C9orf72基因突变则通过RNA毒性作用影响前额叶功能。这类患者可遵医嘱使用多奈哌齐、美金刚等胆碱酯酶抑制剂。
3、遗传代谢缺陷
苯丙酮尿症因PAH基因突变导致苯丙氨酸蓄积，损伤髓鞘形成；线粒体脑病由mtDNA突变引起能量代谢障碍，两者均会造成脑组织进行性损伤。治疗包括低苯丙氨酸饮食、辅酶Q10等代谢支持治疗。
对于有家族史或疑似遗传性脑萎缩者，建议进行全外显子组测序等基因检测。通过遗传咨询可评估后代患病风险，携带致病基因者需定期进行神经影像学随访。早期营养神经治疗如使用胞磷胆碱、维生素B族可能延缓疾病进展。