内窥镜检查属于相对安全的医疗操作，但存在一定的风险和后遗症，发生率通常较低。多数情况下检查过程顺利，少数可能因个体差异或操作因素出现并发症，需在医生指导下进行。
1、常见轻微不适
内窥镜检查后部分人群可能出现咽喉疼痛、腹胀等短暂性不适。例如胃镜可能刺激咽喉黏膜，肠镜注气可能引发腹部胀痛，这些症状通常在数小时内自行缓解，无需特殊处理。
2、严重并发症风险
消化道穿孔发生率约为0.03%-0.1%，多见于存在溃疡、肿瘤等基础病变部位。出血概率约0.1%，常见于活检或息肉切除术后，多数可通过内镜下止血处理。心脏意外等全身性并发症在严格术前评估下较为罕见。
3、感染相关风险
消毒不彻底可能导致幽门螺杆菌等病原体交叉感染，正规医疗机构严格执行消毒流程可将感染概率控制在0.01%以下。免疫功能低下人群需特别注意术后感染迹象监测。
进行内窥镜检查应选择正规医疗机构，严格遵循术前禁食等准备要求。检查后出现持续腹痛、呕血、黑便或发热等症状应及时就医。医生会根据个体健康状况评估检查必要性，采取预防性措施降低风险。