深海鱼油和普通鱼油在来源、成分及功效上存在一定差异。深海鱼油通常提取自深海鱼类，如三文鱼、鳕鱼等，而普通鱼油多来源于浅海或养殖鱼类，如沙丁鱼、鲱鱼等。两者的核心区别主要体现在以下方面：
1、EPA和DHA含量
深海鱼油中EPA和DHA的浓度普遍较高，例如部分深海鱼油每100克含EPA约18克、DHA约12克，而普通鱼油可能分别含10克和8克。这种差异与深海鱼类长期处于低温高压环境，体内需要更多不饱和脂肪酸维持细胞膜流动性有关。
2、污染物风险
深海鱼类因生存环境远离工业污染区，其鱼油中重金属（如汞、铅）和多氯联苯等环境污染物残留量通常低于普通鱼油。但具体含量需参考产品检测报告，正规厂商都会进行严格净化处理。
3、营养成分构成
部分深海鱼油含有天然虾青素等抗氧化成分，能更好保持Omega-3稳定性。普通鱼油可能含有更丰富的维生素D和钙质，如鲱鱼油中维生素D含量可达600IU/100克，这与浅海鱼类光照更充足有关。
4、吸收利用率
研究显示深海鱼油的rTG型（重构甘油三酯型）结构占比更高，在人体内的吸收率比普通鱼油常见的EE型（乙酯型）提升约50%。但具体吸收差异还受个体消化功能影响。
选择时应注意查看产品标签的Omega-3浓度、分子形态及第三方认证标识。心血管疾病高危人群可优先选择高纯度深海鱼油，而普通鱼油对于日常营养补充仍具有性价比优势。建议根据自身健康状况和医生建议进行选择，并注意储存时避光防氧化。