真菌感染的诊断确诊通常需要结合临床表现评估、实验室检查、影像学检查以及分子生物学检测等方法综合判断。具体诊断流程需由专业医生根据个体情况制定。
1、临床表现评估
医生会详细询问患者的病史，包括症状起始时间、持续时间、是否有接触史或免疫抑制状态等。同时进行体格检查，观察感染部位特征如皮肤癣菌感染常表现为环形红斑伴脱屑，深部真菌感染可能出现发热、咳嗽等症状。初步评估可确定疑似真菌感染方向。
2、实验室检查
取病变部位的皮屑、分泌物、血液或组织标本进行检测。直接镜检使用10%氢氧化钾处理标本后查找菌丝或孢子，阳性率约60%-70%。真菌培养需在沙氏培养基中进行，是确诊的“金标准”，但耗时2-4周。组织病理学检查通过特殊染色（PAS、六胺银）显示真菌结构，对深部感染诊断价值较高。
3、影像学检查
胸部CT常用于肺真菌感染诊断，可发现结节影、晕轮征或空洞等特征性改变。头颅MRI对中枢神经系统隐球菌感染具有重要提示作用，可见脑膜强化或胶状假囊病变。影像学表现需与临床表现、实验室结果相互印证。
4、分子生物学检测
应用PCR技术检测真菌特异性基因片段，对念珠菌、曲霉菌等病原体具有较高敏感性和特异性。宏基因组测序（mNGS）适用于重症或罕见真菌感染，可在48小时内检测超过300种致病真菌，但存在定植菌干扰可能。
怀疑真菌感染时应尽早就医，避免自行使用抗真菌药物。临床医生会根据感染部位、严重程度和患者基础状况，选择适宜的诊断组合方案。深部真菌感染常需多学科协作，部分病例需通过病理活检才能最终确诊。规范化的诊断流程对制定针对性治疗方案具有重要意义。