生蒜敷阴茎一般不能起到有效杀菌的作用，且可能对局部皮肤造成刺激或损伤。大蒜虽然含有大蒜素等具有一定抗菌作用的成分，但其浓度和作用方式并不适合直接用于阴茎部位的杀菌处理。
大蒜素在体外实验中确实表现出一定的抗菌效果，但直接敷用生蒜时，其有效成分的浓度和作用时间难以达到理想的杀菌效果。此外，生蒜中的刺激性物质可能破坏阴茎皮肤黏膜的天然屏障，导致红肿、灼痛等不适反应。阴茎部位的皮肤较为敏感脆弱，盲目使用生蒜敷贴可能引发接触性皮炎或继发感染。
若存在细菌感染相关症状，如尿道口分泌物增多、排尿疼痛等，建议在医生指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等正规外用抗菌药物。日常应注意保持外阴清洁干燥，避免不洁性接触，必要时可进行细菌培养检查以明确病原体类型。
出现生殖器不适时，应及时到正规医院泌尿外科或皮肤科就诊，通过专业检查明确诊断后接受规范治疗。避免自行使用未经医学验证的偏方处理敏感部位，以免延误病情或加重局部损伤。