长期使用酮康唑需注意肝功能监测、药物相互作用及激素水平变化。该药物可能引起肝损伤、内分泌紊乱以及与其他药物产生反应，需严格遵循医生指导。
酮康唑属于广谱抗真菌药物，长期使用时可能对肝脏造成负担，需定期检测转氨酶等指标。若出现食欲减退、黄疸等症状，应立即停药并就医。该药物会抑制细胞色素P450酶系统，可能增强抗凝药、降压药及免疫抑制剂的作用，合并用药前应告知医生当前用药情况。
长期应用酮康唑可能干扰肾上腺皮质激素和性激素的合成，男性可能出现乳房发育、性欲减退，女性可能发生月经紊乱。用药期间需监测皮质醇、睾酮等激素水平，必要时给予替代治疗。对于外用剂型，需观察涂抹部位是否出现灼热感、红斑等刺激反应，避免大面积长期使用。
特殊人群如肝功能异常者需禁用，妊娠期妇女可能因药物影响胎儿发育需权衡利弊。建议治疗期间保持低脂饮食，减少肝脏代谢压力，并严格遵医嘱控制用药周期，防止真菌耐药性产生。任何不适症状出现时，应及时复诊调整治疗方案。