新冠变异株是否会影响疫苗效果，通常不能一概而论，需结合变异株的免疫逃逸能力及疫苗类型等因素综合判断。现有疫苗对部分变异株的防护效果可能减弱，但仍能有效降低重症风险。
若新冠病毒变异株的抗原性与原始毒株差异较小，现有疫苗诱导的抗体通常仍可识别并中和病毒，防护效果所受影响较为有限。例如针对德尔塔变异株，疫苗防重症有效率仍可达80%以上。当病毒发生重大抗原变异时，如奥密克戎变异株出现大量刺突蛋白突变，可能导致疫苗防感染效果下降，但加强针接种可显著提升中和抗体水平。
疫苗研发机构会持续监测病毒变异情况，针对重要变异株开发针对性疫苗。目前我国已有多价新冠疫苗获批使用，包含原始株和奥密克戎变异株抗原成分，可提供更广谱的保护。现有研究显示，接种三剂灭活疫苗对奥密克戎重症的保护率仍维持在90%左右。
建议未完成基础免疫人群及时接种疫苗，符合条件者尽早接种加强针。60岁以上老年人等高风险人群，在末次接种3-6个月后可视情况接种含变异株成分的新冠疫苗。日常仍需做好个人防护，出现发热等新冠相关症状及时进行抗原检测。