乙肝E抗原阳性是否影响肝功能需要根据具体情况判断。若乙肝病毒复制活跃导致肝脏炎症损伤，则可能影响肝功能；若未引起明显肝损伤，则可能暂时不影响。
1、存在肝损伤
乙肝E抗原阳性通常提示乙肝病毒复制活跃，传染性较强。当病毒持续复制引发肝脏炎症时，肝细胞受损会导致谷丙转氨酶、谷草转氨酶等指标升高，可能出现乏力、食欲下降等症状。此时提示肝功能异常，需及时进行抗病毒治疗。
2、无肝损伤
部分乙肝病毒携带者虽然E抗原阳性，但机体免疫系统未对病毒产生强烈反应，肝脏未出现明显炎症或纤维化。这种情况下转氨酶水平通常正常，腹部彩超等检查也无异常，提示肝功能未受明显影响。
建议乙肝E抗原阳性患者定期复查肝功能、乙肝DNA定量、肝脏彩超等检查。若发现转氨酶升高或病毒载量过高，需遵医嘱使用恩替卡韦、替诺福韦等抗病毒药物。日常生活中应严格戒酒，避免滥用伤肝药物，保持规律作息以减轻肝脏负担。