真菌感染的治疗周期通常受感染类型、患者免疫状态、用药依从性、感染部位以及药物选择等因素影响。不同情况下治疗时长可能存在差异，需根据具体病情制定方案。
1、感染类型
浅层真菌感染如手足癣一般需2-4周治疗，而深部真菌感染如侵袭性曲霉菌病可能需要数月至半年。真菌种类差异直接影响疗效，念珠菌感染与隐球菌感染的治疗周期存在明显区别。
2、患者免疫状态
免疫功能正常者治疗反应较快，HIV感染者或器官移植患者因免疫力低下，真菌易复发或播散，常需延长疗程3-6个月。糖尿病等基础疾病控制不佳时，皮肤真菌感染愈合时间可能增加50%以上。
3、用药依从性
规范使用抗真菌药物如氟康唑胶囊、伊曲康唑胶囊、特比萘芬片等对疗程控制至关重要。自行减量或中断用药可使有效率下降40%，并诱发耐药性，导致治疗周期成倍延长。
4、感染部位
指甲真菌感染因甲板结构特殊，口服药物需持续3-6个月直至新甲完全生长。头癣需配合剃发和外用联苯苄唑乳膏，疗程约6-8周。肺部真菌感染静脉用药至少2周后需改为口服序贯治疗。
5、药物选择
局部感染使用克霉唑乳膏1-2周可见效，而系统性感染需静脉注射两性霉素B脂质体2-4周。药物敏感试验可指导精准用药，将平均疗程缩短15-20天。
治疗期间应严格遵医嘱完成规定疗程，定期复查肝功能等指标。保持患处清洁干燥，避免交叉感染，免疫力低下者需加强营养支持。出现耐药或病情反复时应及时进行真菌培养及药敏试验调整方案。